avva: (Default)
[personal profile] avva
Прошёлся по архивам и нашёл все (надеюсь) записи в своём дневнике о дарвинизме и эволюции. Пусть лежат здесь для удобства. Ко всем этим темам хотелось бы вернуться как-нибудь.


Особенно к статье Коди хотелось бы вернуться; я так и не увидел убедительных опровержений его главного тезиса.

Как обычно, все комментарии приветствуются, особенно те, которые объясняют мне, в чём я неправ.

Update: Выложил статью Коди (PDF, 112kb). Не со всем я в ней согласен; наиболее интересующий меня аргумент (с примером про кита) появляется в третьей части статьи, но в любом случае принимаются с благодарностью комментарии любого рода по этой части или о статье вообще.
Page 1 of 3 << [1] [2] [3] >>

Date: 2003-07-15 12:33 pm (UTC)
From: [identity profile] p-k.livejournal.com
Вот еще дискуссия (http://www.livejournal.com/users/igor_a/10386.html) у [livejournal.com profile] igor_a. Там в конце есть кое-какие ссылки, мне понравилась вот эта (http://asterion.rockefeller.edu/marcelo/Reprints/p01_geilo01.pdf) статейка про эволюцию самого эволюционного механизма.

Date: 2003-07-15 01:20 pm (UTC)
From: (Anonymous)
А чего его опровергать, когда он прав на все сто (хотя я его не читала). Но выводы делает неправильные. А правильные выводы такие: да, в ДНК содержится наследственная информация. Но. В ней содержится далеко не вся наследственная информация. То, что ДНК -- это носитель наследственной информации, было доказано на бактериях. Тогда все так обрадовались (нобелевка, все дела), что других носителей уже не искали. Это все равно как если бы нашли в компьютере пезеушку и, ничего не зная о жестком диске, чесали бы репу: как же это все работает, когда просто физически все эти программы в ПЗУ поместиться не могут.
На самом деле в ДНК записана только та часть наследственной информации, которая у нас общая с бактериями: как переваривать глюкозу, как делать АТФ и так далее. На этом уровне человек ничем от всей прочей твари не отличается. Ну, там, не может делать аскорбиновую кислоту (от этого у него бывает цинга). Зато делает мочевую кислоту (от этого у него камни в почках). А что на двух ногах? А умище? Ничего неизвестно. Сколько ни изучали уродства, дебильность, -- не нашли ни одного гена, который отвечает за то, чтобы руки росли откуда надо, а не из жопы.
Недавно в не заслуживающем доверия источнике прочла, что дело, может быть, в гистонах -- это такие белки, на которые намотана ДНК. Очень может быть. И очень может быть, мы стоим на пороге очередного переворота в науке.

Фаина

Date: 2003-07-15 01:35 pm (UTC)
From: [identity profile] dyak.livejournal.com
Главный (#1) тезис Коди несколько раз обсуждался Гулдом не в пользу тезиса.

#2 совершенно неубедителен. Из "простых" правил могут следовать "сложные" результаты.

Date: 2003-07-15 01:38 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Так рассуждать (это я о Коди) некорректно. Много-мало-долго-быстро - это все субъективные понятия. Скажите конкретно "сколько"!

Если мы говорим о китах, то надо привести цифры - сколько именно мутаций в геноме предка кита должно было случиться для того, чтобы он мог нырять на 5 км вниз? Сколько времени прошло от того момента, когда киты не могли нырять, до того, когда смогли? Какова аккуратность репликации ДНК? Каков размер популяции? Сколько времени уходит на смену поколения? Какова роль рекомбинации? Насколько строг был отбор?

Наука оперирует конкретнымим фактами; размахивать руками и кричать, что "так не может быть никогда" может каждый.

И вот самый главный вопрос, на который в данном случае ответить практически невозможно: сколько существует вариантов геномов, позволяющих нырять на 5 км? Именно это число (которое, без сомнения, астрономически велико) надо сравнивать с вероятностями подсчитанными так, как предлагает считать Коди.

Date: 2003-07-15 01:52 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Сколько ни изучали уродства, дебильность, -- не нашли ни одного гена, который отвечает за то, чтобы руки росли откуда надо, а не из жопы.

Это неверно. Полным-полно таких генов известно.

Date: 2003-07-15 01:54 pm (UTC)
From: (Anonymous)
Примерчик можно?

Re:

Date: 2003-07-15 01:54 pm (UTC)
From: [identity profile] avva.livejournal.com
Ссылку на Гулда, если можно. Я читал у него что-то подобное, не помню где, но там были слишком общие утверждения в том смысле, что мутация одного гена может проявляться в разных органах; это само по себе не решает проблему.

Насчёт #2 в общем согласен, неубедительно; но, возможно, может быть сделано более убедительным.

Date: 2003-07-15 02:04 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Вот, случайно выдернут из примерно 2000 статей найденых по ключевым словам "human retardation genetic defect":

Mine, M., Brivet, M., Touati, G., Grabowski, P., Abitbol, M., and Marsac, C. (2003). Splicing error in E1alpha pyruvate dehydrogenase mRNA caused by novel intronic mutation responsible for lactic acidosis and mental retardation. J Biol Chem 278, 11768-72.

Date: 2003-07-15 02:09 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
>Особенно к статье Коди хотелось бы вернуться; я так и не увидел убедительных опровержений его главного тезиса.

Ja ne prochital shodnoj stat'i, tol'ko Vashi izvlechenija. Tam napisano:
"Вывод у Коди таков: вопреки заявлениям биологов-эволюционистов,..."
Так вот тут то, пожалуй, Коди и лукавит, не читал он _биологических_ работ по теории эволюции. Ну или читал, но не понял, хотя это и вряд ли. Скорее всего, то, что он именует заявлениями/взглядами биологов-еволюционистов, это представления которые он почерпнул в статье другого опровергателя. А тот, в свою очередь, у другого... и т.д. Я впервые что о подобное читал в статье тридцатилетней давностии
Так что механизм еволюции, который Коди критикует и которому якобы не хватит времени на работу вряд ли кто-нибуть защищать возмется. Ввиду отсутствия сторонников.
Это было про первую претензию, а второй я просто не понял. Как это "что 100,000 протеинов для построения такой системы - это явно недостаточно" когда она именно из них именно и из стольки состоит, де факто?? Число взял Ваше, не суть.

Date: 2003-07-15 02:10 pm (UTC)
From: [identity profile] ex-ilyavinar899.livejournal.com
Случайная мутация ДНК не может объяснить направленного изменения функциональности в организме

Разница между шпицем и волком, или между маисом и теосинтом своим существованием обязана случайным мутациям ДНК за малый промежуток времени (порядка 5000 лет), закрепленным искусственным отбором (т.е. естественным отбором в искусственных обстоятельствах). Разница между китом и коровой больше, чем разница между шпицем и волком, но и селекция китов проходила десятки миллионов лет, а не тысячи.

I refute you thus.

Re:

Date: 2003-07-15 02:23 pm (UTC)
From: [identity profile] avva.livejournal.com
Простите, но если это так, то, может быть, Вы сможете объяснить, что именно не понимает Коди в механизме эволюции, что позволяет опровергнуть его аргумент?

Что касается второй претензии, то, насколько я понимаю, суть её в том, что раз такого количества не хватает по сложности, должны существовать какие-то другие, пока неизвестные, дополнительные механизмы. Впрочем, с этой претензий я не согласен, по крайней мере в таком виде.

Было бы интересно, тем не менее, услышать более развёрнутое мнение по поводу первой претензии. Если не ошибаюсь, Вы - биолог? Если хотите, я могу выложить всю статью Коди в сеть, чтобы можно было судить по ней, а не по моему пересказу.

Re:

Date: 2003-07-15 02:24 pm (UTC)
From: [identity profile] avva.livejournal.com
Я не вижу здесь опровержения. По сравнению с разницей между китом и коровой разница между шпицем и волком абсолютно тривиальна.

Date: 2003-07-15 02:27 pm (UTC)
From: (Anonymous)
Ой, нет. Извините, я не уточнила. Примеры типа фенилкетонурии (и вашего), не годятся. В них речь идет просто об общем отравлении организма (в вашем примере -- молочной кислотой). Ясно же, что это никак не раскрывает того, какие гены отвечают за тот или иной склад ума. Ну, фиг с ним, с умом, это штука сложная. Возьмем лучше физические уродства. Если у них и находят какую-то генетическую основу -- это всегда очень грубые нарушения на уровне хромосом: делеция (утрата крупного участка), трисомия (лишняя хромосома). Никакого гена, который отвечает, например, за прямохождение, неизвестно. И то же самое -- со всеми теми признаками, которые наиболее очевидно отличают нас от других тварей Божьих.

Фаина

Date: 2003-07-15 02:33 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
В дополнение к тому, что существует огромное количество геномов, позволяющих нырять на 5 км, приведу пример из близкой мне области:

Обратная транскриптаза переводит РНК геном вируса СПИДа в ДНК. Это один из самых сложных сценариев репликации в живом мире, требующий трех разным ферментных активностей и он полностью осуществляется одним белком. Этот же самый процесс осуществляется обратной транскриптазой одного мышиного ретровируса. Каково сходство между этими двумя белками? 50-60% гомологии (не идентичности, а гомологии) в аминокислотной последовательности. Их последовательности ДНК не имеют почти ничего общего.

Гибкость биологических систем настолько велика, что она служит прекрасным противовесом низким вероятностным шансам.

Date: 2003-07-15 02:36 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Прямохождение - слишком сложная штука, чтобы за нее отвечал один ген, именно поэтому генетический дефект должен быть достаточно большим, для того, чтобы был виден эффект.

Вас устроит ген, нарушения в котором привели бы к полному отсутствию глаз у ребенка?

Date: 2003-07-15 02:39 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Если не трудно, то выложите, пожалуйста, всю статью.

Спасибо

Re:

Date: 2003-07-15 02:41 pm (UTC)
From: [identity profile] avva.livejournal.com
Если мы говорим о китах, то надо привести цифры - сколько именно мутаций в геноме предка кита должно было случиться для того, чтобы он мог нырять на 5 км вниз?

Проблема не в том, сколько мутаций, а в том, сколько независимых друг от друга мутаций в генах, управляющих разными органами, причём только их общее сочетание могло позволить киту нырять глубже.

Я выложу статью и поставлю на неё ссылку в тело записи через несколько минут.

Date: 2003-07-15 02:48 pm (UTC)
From: [identity profile] nevsky.livejournal.com
Как я понял из вашего изложения, Коди предполагает, что мутации случаются последовательно: попробовали одну -- не получилось -- попробовали другую -- и т.д. А мне бы казалось, что они все должны происходить одновременно, как на недетерминированной машине Тьюринга. Вот вам и экспоненциальное ускорение эволюции...

Date: 2003-07-15 02:49 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
сколько независимых друг от друга мутаций в генах, управляющих разными органами

Ну так сколько? А главное (я еще раз повторю, потому что это очень важно), сколько существует вариантов генома кита, позволяющих глубоко нырять? Эволюция не направлена, она не стремится к какому-то конкретному набору мутаций, а работает с тем, что появляется первым.

Date: 2003-07-15 02:49 pm (UTC)
From: [identity profile] vasja-iz-aa.livejournal.com
>Если не ошибаюсь, Вы - биолог?

:))
A Vy - matematik?
>Если хотите, я могу выложить всю статью Коди в сеть, чтобы можно было судить по ней, а не по моему пересказу.

Mne bylo b proshe pridrat'sja k bolee podrobnomu izlozheniju, no, v principe, i pereskaza dostatochno. Kak Vam udobnej.

Date: 2003-07-15 02:50 pm (UTC)
From: (Anonymous)
Ну... Что-то вы меня испугали. (А вдруг правда? Неужто отказываться от выношенного?) Анофтальмия бывает при трисомии по 13-й хромосоме. А чтоб один ген? Ну, давайте, а там посмотрим.

PS. На всякий случай, если я в результате вашего ответа выпаду в осадок. Вот мое кредо. ДНК отвечает только за обмен веществ. А что отвечает за строение тела, мы просто не знаем. А именно в этом суть эволюци. Поэтому все рассуждения на эту тему -- до разбирательства с этим вопросом -- чисто умозрительны.

Date: 2003-07-15 02:55 pm (UTC)
From: [identity profile] p-k.livejournal.com
Анатолий, Вы про морфогены слышали? Как с помощью нелинейного дифура описывают поцесс формирования сегментов брюшка дрозофилы? И еще как решая обратную задачу, определяют, в какой момент нужно выровнять концентрацию морфогенов со стороны головы и хвоста, чтобы вышло две головы. И, решив, прокалывают яйцо в нужный момент, после чего таки получают двухголовую "муху".

Никакое рассуждение про эволюцию многоклеточных не может быть серьезным, пока оно не рассматривает эволюцию механизма морфогенеза. Потому что ключ к проблеме астрономического числа модификаций, которые должны быть "перебраны" при эволюции тут и лежит. Морфогенов реально мало, и пространство состояний, которое надо обследовать вовсе не столь многомерно.

Re:

Date: 2003-07-15 02:56 pm (UTC)
From: [identity profile] avva.livejournal.com
Правильный вопрос - не сколько существует таких вариантов (этот вопрос чисто умозрительный, мы не можем знать), а каково отношение кол-ва таких вариантов к общему комбинаторному кол-ву возможных геномов. Это последнее столь велико, что даже очень оптимистичная оценка кол-ва возможных геномов ныряющего кита по сравнению с ним совершенно ничтожно.

Выложил статью, см. изменение в записи.

Re:

Date: 2003-07-15 03:02 pm (UTC)
From: [identity profile] avva.livejournal.com
Морфогены - это то же, что по-английски называется homeobox genes? Если да, то слышал; Коди в своей статье рассматривает эту проблему (я выложил статью, см. ссылку в записи, если интересно).

Небольшое изменение в генах, которые управляют порядком "подключения" других генов, может привести к серьёзным изменениям, типа второй головы или ног вместо глаз. Но изменение фундаментального строения органа требует мутации не только в управляющем гене, "составляющем" орган из частей, но и в генах, описывающий строение этих частей, не так ли? -- при этом эти мутации обязаны быть независимыми друг от друга, что опять же резко увеличивает кол-во возможных переборов.

Date: 2003-07-15 03:02 pm (UTC)
From: [identity profile] shvarz.livejournal.com
Придется пугать дальше :(

Посмотрите литературу про гены Pax6, Lhx2, Chx10, Six6, Six3, Rx. Мутации во всех этих генах ведут либо к полной потере глаз, либо к микрофталмии. Обзорная статья Chow and Lang, 2001. Случается довольно часто (один на 10.000 беременностей).

Существует огромное количество литературы относительно того, что гены регулируют формирование органов. Моя жена занимается генетикой развития, у нас весь дом завален такими статьями :) Если Вы считаете, что все эти ученые неправы, то Вы ставите себя на одну линию с самоучками пытающимися на пальцах доказать, что теория Энштейна неверна...
Page 1 of 3 << [1] [2] [3] >>

December 2025

S M T W T F S
  123 4 56
78 9 10 11 1213
1415 1617181920
21 22 23 24 2526 27
2829 30 31   

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 1st, 2026 10:59 pm
Powered by Dreamwidth Studios